Простой способ придать хоть какую-то индивидуальность своему проекту на Mediawiki — это изменить логотип.
Необходимо подготовить картинку с логотипом (я делал в формате PNG), размерами не превышающими 135×135 точек. Если картинка будет меньше (допустим по высоте), то она установится автоматически по середине того места, которое под неё отведено в скине Mediawiki.
Имя картинки сделаем, например, mylogo.png. Далее помещаем картинку в каталог /skins. Можно в другой каталог Mediawiki или в один из подкаталогов /skins. Это дело вкуса. Главное указать потом правильный путь до картинки.
Осталось изменить в Mediawiki файл настроек LocalSettings.php, который находится в корне. Ищем в данном файле соответствующий параметр и устанавливаем его значение:
$wgLogo = "$wgStylePath/mylogo.png";
Готово.